一是农业防治。突击清沟理墒，排水降渍；摘除下部枯、老、黄、病叶，带出田外，中耕松土，清除田间杂草、子囊盘，减少菌源，改善田间的通风透光条件；增施硼肥，促进油菜健壮生长，增强其抗病能力。
二是药剂防治。油菜菌核病是典型的气候型病害，必须采取“主动出击，药肥混喷，防病增重”的防治策略，全面用好两次药。防治适期：掌握在油菜盛花初期（即主茎开花株率80%）用第一次药，隔7～10天再用好第二次药。药剂配方：亩用40%多-酮-福美双（绿满园）或40%多-酮可湿粉120～150克，对水50公斤喷雾。有蚜虫的田块每亩加30%S—氰戊-辛硫磷（绿保1号）40毫升或5%啶虫脒40毫升一并喷雾。为提高油菜结实率，施药时加入代代红（或氨基酸多肽钾）40～60克或优质硼肥100克。药剂先配成母液，再对足水量。喷药时要均匀周到，上下喷透，以保证防治效果。
