大豆中后期需选用合理的农药防治病虫。降雨较多有利于病虫害发生，应重点防治以下常见病虫害。
（1）食心虫：当田间出现成虫打团飞，并且每团蛾量较大时进行防治。每亩用80％敌敌畏乳油100～150毫升，用玉米秸秆蘸药熏蒸。具体方法是：选带两个节间的玉米秸秆，一端去皮留穰蘸药，另一端留皮插入田间，每亩插40～50根，均匀插在垄台上。对封垄不好的豆田，每亩用2.5%高效氯氟氰菊酯乳油20毫升，2.5%溴氰菊酯乳油或2.5%功夫乳油或25%辉丰快克乳油20～30毫升，对水2千克喷雾。50%杀螟硫磷乳油1000倍液喷雾对初入荚的幼虫也有较好的防治效果。
（2）大豆蚜虫：百株蚜量达到1000头时，每亩用2.5％功夫15毫升，35%伏杀磷AI25千克，或3%啶虫咪乳油15～20毫升进行防治。
（3）红蜘蛛：点片发生时应及时防治。每亩用48%毒死蜱乳油100毫升与1.8%阿维菌素20毫升混用喷雾，或15%扫螨净乳油3000倍液，5%霸螨灵悬浮剂1000～2000倍液喷雾。喷雾要喷到叶的正反两面，喷雾要均匀，不要漏喷。
（4）灰斑病：当大豆30％出现病斑时，喷洒70％甲基托布津或50％多菌灵可湿性粉剂，每亩用量为100克，施药1～2次，间隔7～10天。
（5）菌核病：每亩用25％施保克70～100毫升+0.13％康凯2～3克或益微20～30毫升＋米醋100毫升；或40％菌核净50～70毫升+0.13％康凯2～3克或益微20～30毫升+米醋100毫升。以上各配方药剂对水喷施，7～10天后再喷一次。
（6）霜霉病：用58％瑞毒霉锰锌600～800倍液；或50％退菌特500～1000倍液喷雾。以上药剂每7～10天喷一次，共喷2～3次。
