（1）菌丝长不上土层主要是培养料发酵过熟或偏生或培养料和覆土pH值不当；或因覆土后喷水过多，流入料层造成菌丝萎缩或死亡。栽培上应采取加强通风，调节ph值和料中打扦散发过多的水分来补救。
（2）高温死菇由于温度过高湿度过大造成菇蕾变黄或死亡。管理上以加强通风，停止喷水，降低室温等措施来减少死菇。
（3）密菇主要由于培养料过薄或偏干；或覆土太薄，菌丝冒过细土以及管理不善，造成菌丝生活力弱，出菇密，菇体小，质量差。故应采取追肥补土和保持正常温度等措施防止密菇。
（4）硬开伞由于温度降低或昼夜温差过大空气干燥，或培养料过湿等造成菌丝生活力弱，使未成熟的子实体易产生硬开伞，常采用保温，增加空气湿度等防止硬开伞发生。
（5）畸形菇覆土过厚，土粒过大，细土覆盖过迟以及湿度过高，通风不良等原因，常出现部分畸形菇。防止的措施主要是采用的土粒大小要适当，盖土适时，土层不得过厚，其次是加强水分、通风管理等。
（6）空柄白心菇当气温高，水分供应不足以及气温偏低，蘑菇生长缓慢，在菇床停留时间过长，都会产生空柄白心现象。主要以加强温度和水分管理来防止。
