1、清除病残体，降低棚室病菌数量。在前茬收获后及时将病残体掩埋或焚烧，减少病菌的数量。
2.做好消毒工作，切断病菌传播途径。播种前要对种子进行晾晒、温汤或药剂浸种；对营养土进行消毒，防止病菌侵入或交叉感染。
3.采用农业措施，提高甜瓜的抗病能力。选用抗病品种，培育壮苗，种植不可过密，注意浇水时间和浇水量，尽量小水勤浇，以保持较低的棚室湿度，防上病菌多次浸染，造成病害流行。
4.预防为主，综合防治。采用吡效隆等植物生长调节剂蘸花时，在吡效隆水溶液中加入几滴农用链霉素；在灌水前后及时喷保护性杀菌剂，如大生-M45、品润等进行预防，出现病害时要及时用药防治。在植株生长中后期，可以使用可杀得2000、进口甲托等杀菌剂喷雾防治，连阴天时可以使用烟雾剂或粉尘剂，效果较好。
