辣椒根腐病是辣椒常见的病害之一，各菜区均有发生，露地栽培、保护地栽培都可发病。春季多雨、梅雨期间多雨的年份发病严重。发病严重时常造成根系腐烂、植株枯死。
为害症状
定植后，起初病株白天枝叶萎蔫，傍晚至次晨恢复，反复多日后整株枯死。病株的根颈部及根部皮层呈淡褐色至深褐色腐烂，极易剥离，露出暗色的木质部。病部一般仅局限于根及根茎部。该病近年发生面积迅速扩大，为害日趋严重。
发病规律和发病条件
以厚垣孢子、菌核或菌丝体在土壤中越冬，成为翌年主要初侵染源，通过雨水或灌溉水进行传播和蔓延。播种、定植过早，气温低，地温低于12℃发病重。其传播途径随其毒源种类不同而异，但主要可分为虫传和接触传染两大类。
可借虫传的病毒主要有黄瓜花叶病毒、马铃薯Y病毒及苜蓿花叶病毒，其发生与螃虫和葫马的发生情况关系密切，特别遇高温干旱天气，不仅可促进蚜虫传毒，还会降低寄主的抗病性。传播辣椒病毒病的葫马有茶黄蓟马和棕榈蓟马。烟草花叶病毒靠接触及伤口传播，通过整枝打杈等农事操作传染。此外，定植晚、连作地、低洼及缺肥地易引起该病流行。
防治方法
1.因地制宜，适期早播，是防治该病最基本的方法。
2.用次氯酸钠浸种。在浸种前先用0.2%~0.5%的碱液清洗种子，再用清水浸种8~12小时，捞出后置入配好的1%次氯酸钠溶液中再浸5~10分钟，冲洗干净后催芽播种。也可用咯菌腈进行种子包衣。
3.加强田间管理。防止菜地积水；注意施用腐熟有机肥。
4.发病前喷淋或灌锌柠·络氨铜可湿性粉剂800倍液、50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂1000倍液、20%二氯异氰尿酸可溶性粉剂300~400倍液，隔10天左右1次，连续灌2~3次。
