1、温度：幼穗分化期最适温度为26-30度。昼温35度左右、夜温25度左右的温差最利于形成大穗。幼穗分化过程对低温的敏感时期是在减数分裂盛期如遇17度以下低温，花粉粒的正常发育就会受到影响，如遇15度以下低温，会导致雄性不育，出现空粒，可在夜间灌水20厘米，提高穗部温度。
2、日照时数和光照：日照时数过短或光照不足，都会造成分化的枝梗及颖花退化。
3、水分：水稻进入幼穗分化期，植株生长量急剧增大，此期为水稻一生中生理需水最多的时期，不能缺水，但长期淹水也是不利于根系发育，进而影响水稻穗分化。
4、营养：幼穗发育期间，特别在减数分裂前，养分不足会导致枝梗和颖花的退化。
