小麦秸秆还田应注意“及时，细碎，散匀，增氮，塌实，补墒”。“及时”，就是在玉米收获后要趁玉米秸秆水分含量较高时及时翻压入土，适当耙耱压实，有利于快速腐烂转化。“细碎”，就是要充分粉碎，翻压入土。“散匀”，就是让秸秆均匀分布在土中，避免密集成堆。“增氮”，就是要适当增施氮肥，防止土壤碳氮比失调，引起生物夺氮，造成小麦前期幼苗缺氮。“塌实”，就是避免地虚，同时结合“补墒”，为微生物活动创造一个合适的环境条件，以利于秸秆腐解。
此外，还必须搞好病虫害防治。由于作物秸秆所带的病菌很容易通过土壤传播，在玉米生长期间如果病害严重，则不宜进行秸秆直接还田。还需要防治随着秸秆还田后逐渐加重的地下害虫，确保小麦优质生产。
