（一）品种选择种植当地品种可采用单株逐年提纯复壮、选无病田块无病株作种蒜等，这也是选取无病优质蒜种的一个途径。另外将当地优良品种进行脱毒后种植，是防治病毒病的根本措施。
（二）农业防治
1、合理轮作大蒜叶枯病、紫斑病、煤斑病等病害病原菌均能在土壤或病残体中越冬或越夏，造成病原基数上升。一般蒜田应与非百合科作物进行3～5年的轮作，减少病原基数，保证土壤中某些营养元素的补充，减轻病害发生。
2、合理排灌大蒜根系既不耐旱又不耐涝，土壤干燥要及时浇水，还有利于抑制蓟马的发生，雨量过大，及时排水，借此机会撒施草木灰，降低田间湿度，增施钾肥，还可有效抑制灰霉病、根蛆的危害，达到增产防病的目的。
3、及时清洁田园在病虫害易发地区或田块尤为重要。清除病残体，及时拔出中心病株，带出田园处理，是防止病害流行的一个重要手段。
（三）化学防治当病虫害大面积发生和流行时，应及时用药防治。
1、病害防治
病毒病发病初期喷药，7～10天左右一次，连续2～3次。可用1.5％植病灵乳剂1000倍，20％病毒A可湿性粉剂500倍，83增抗剂100倍液、抗毒剂1号水剂250～300倍液等。
煤斑病可选用65％代森锌可湿性粉剂400～600倍液或1：1：100的波尔多液防治。
叶枯病可选用75％百菌清可湿性粉剂600倍液、50％扑海因可湿性粉剂1500倍液、64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、60％琥、乙磷铝可湿性粉剂500倍液、1：1：100波尔多液防治。
紫斑病可选用75％百菌清可湿性粉剂500～600倍、64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、58％钾霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液、50％扑海因可湿性粉剂1500倍液防治。
对灰霉病、霜霉病可用75％百菌清可湿性粉剂600倍液、50％甲霜铜可湿性粉剂800～1000倍液、64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、72.2％普立克水剂800倍液、72％乙·锰可湿性粉剂500倍液防治。
锈病可用20％三唑酮乳油2000倍、97％敌锈钠可湿粉300倍液、25％敌力脱乳油3000倍液防治。
2、虫害防治
葱蓟马可用灭杀毖6000倍液、50％辛硫乳油1000倍液、50％乐果乳油1000倍液、10％菊·马乳油1500倍液、25％增效喹硫磷乳油7000倍液喷雾。
根蛆成虫和幼虫都要防治。防治成虫以灭杀毖6000倍液、2.5％溴氰菊酯3000倍液隔7天一次，连防2～3次。防治幼虫可用50％辛硫磷800倍液、90％晶体敌百虫1000倍液或50％乐果1000倍液灌根。
此外，蒜蟃若大发生可用灭杀毖2000-4000倍液喷雾防治。贮藏期可用磷化铝6g/m2熏蒸防治咖啡豆象。
