一、精选种子
质好新鲜的冬瓜种子，其表面清白而具有光泽，发芽率高；陈旧冬瓜种子表皮发黄而无光泽，发芽率低。筛选冬瓜种子时应清除杂籽、秕籽及虫蛀、带病伤、破碎的种子，选留籽粒饱满，完整的种子。一般每亩用种量为150~250克。
二、冬瓜种子消毒
由于冬瓜种子的厚壁细胞和海绵柔细胞组织层较厚，妨碍种子的吸水和氧气的透过，导致冬瓜种子的发芽比其他种子要困难一些。另外冬瓜种子上可能带有枯萎病、炭疽病、疫病等多种病原菌，因此一般多采用温汤浸种和其他种子表面消毒的方法处理种子：
1、温汤浸种：即将干种子浸入55~60℃温水中约10分钟，期间不断搅拌，待水温降到30℃左右时，再浸泡12~14小时，淘洗干净后进行催芽。
2、药剂消毒：常用0.1%的多菌灵浸种1小时，用清水冲洗后再用清水浸种12~14小时，或用0.1%~0.2%高锰酸钾溶液浸种30分钟，或用1%硫酸铜浸种5分钟，或用40%福尔马林150倍液浸种90分钟。药剂消毒一般要求在浸种前进行，药剂浸种后应立即用清水冲洗，以免发生药害，浸泡所用的药液温度为30℃，药液浓度不能过高或过低。
三、冬瓜种子催芽
冬瓜种子经过上述方法处理后，淘洗几遍，捞出清洗，将种子表面的粘液污物洗去，去水甩干，用布包好，置于恒温箱或其他温暖处于30~35℃下催芽，催芽过程中要常翻动种子（每天翻动1~2次），使其均匀受温，经5~7天便开始出芽，大部分种子萌发芽时便可播种。
