缺钙植株顶端先表现症状，叶片变小，叶边缘黄化、扭曲，生长点及其附近枯死或停止生长；果实上出现浅褐色凹陷斑，严重缺乏时，褐色区扩大，表现为脐腐病。缺钙的主要原因是施用氮肥、钾肥过量，阻碍对钙的吸收和利用；土壤干燥、土壤溶液浓度高，也会阻碍对钙的吸收；空气湿度小，蒸发快，补水不及时及缺钙的酸性土壤上都会发生缺钙。补救措施多施有机肥，配方施肥，增加土壤钙素的含量。发生缺钙时，喷洒络合钙或辣椒壮蒂灵或磷酸氢钙500～1000倍液，其中以喷洒辣椒壮蒂灵的效果最好。
缺镁辣椒缺镁常始于结果期，叶片沿主脉两侧黄化，逐渐扩展到全叶，仅主脉、侧脉仍保持清晰的绿色。一株辣椒上所结的果实越多，缺镁现象越严重。土壤中含镁量低，过量施用钾肥和铵态氮肥，土温低，多雨或干旱、强光等，都可能引起缺镁。补救措施增施有机肥，配方施肥，防止过量施用氮肥和钾肥。对于土壤供镁不足造成的缺镁可施镁肥补充，一般用硫酸镁等，每亩用量2～4公斤。对于根系吸收障碍而引起的缺镁，应采用叶面补镁来补救。一般可用1%～2%硫酸镁溶液+新高脂膜800倍液喷洒，每隔5～7天喷1次，连喷3～5次。也可喷施硝酸镁。
