发病部位以果实为最典型，在果实膨大时期，顶部出现坏死，呈黑色腐变，随着果实膨大，坏死部分相应增大，并腐生霉菌，形成黑腐状，对这种症状农民一般称其为“黑膏药”。除了果实以外，上部叶片也出现黄化，叶尖叶缘萎蔫，叶柄扭曲等，严重时植株生长点坏死；根部症状，先是根尖细胞发育不良，进而出现坏死。
症状特点：主要是发生在番茄果实膨大期的果顶和根、茎、叶的新生部位；先是细胞组织软化，后是霉菌入侵腐变，在采用组织解剖与测试相结合的大量分析后，发现这是番茄组织缺钙所导致的生理性缺素症，原初发生并非由病菌侵染所致。
