土壤病害是指病原菌随植株病残体或以病菌孢子、菌丝体等形式潜伏于土壤中，待下一栽培季节遇到寄主后，开始新的侵染循环。它以土壤传播病原菌为主，但种薯也是主要的带菌媒体。
马铃薯土传病害主要包括黑痣病、干腐病、疮痂病、和粉痂病等。土壤病害的防治一方面要减少土壤中的侵染源，另一方面要减少种薯中所携带的病原菌。因此，综合防治是控制土传病害的有效防治途径。
黑痣病
1.选用抗病品种：适当选用早熟品种能够减轻该病害发生。2.生物防治：木霉菌对立枯丝核菌类的病害具有良好的防治效果。3.农业防治：轮作：与燕麦，大豆等非寄主作物轮作，如果病害发生比较严重应最少进行3～5年轮作。无病种薯：选用块茎表面没有菌核的种薯。加快出苗：适期晚播，测定土温；播种厚度不超过5厘米，尽量缩短出苗时间，减小病原菌侵染幼芽的概率。控制土壤温度：出苗前应尽量减少灌溉，合理控制土壤温度。
枯萎病和干腐病
1.生物防治：哈茨木霉T-22菌株，它能够抑制作物的立枯菌核菌、腐霉等一些真菌的生长，用其处理种子，灌溉温室土壤或进行沟施，都能够在作物根系的所有部位定植，且能维持很长时间，在温室及田间具有明显的防效。2.农业防治：加强田间管理，清除田间病株及枯枝落叶减少土壤菌落。3.化学防治：种薯处理：①用2.5%适乐时种衣剂（咯菌腈）切种后包衣，每100千克种薯需100～200毫升的种衣剂，阴干后播种。②或好立克（43%的悬浮剂，有效成分：戊唑醇）沟施，剂量为推荐浓度。
疮痂病
1.轮作:疮痂病的发生与轮作关系密切，因此尽可能与葫芦科、豆科、百合科等非块茎类蔬菜进行轮作，依据国外研究最好4年轮作。2.使用抗病品种：如美国使用高抗马铃薯疮痂病的品种Marcy。3.农业防治：土壤pH5.0以下疮痂病就很少发生，栽培马铃薯应选择偏酸性土壤。在其他条件相同的情况下，少水多次浇灌。4.化学防治：种薯可用0.1%对苯二酚浸种30分钟，或0.2%福尔马林溶液浸种10～15分钟。
粉痂病
1.合理轮作：轮作过程中最好进行压青处理。2.农业防治：控制土壤湿度，增加通风性。3.化学防治：用福帅得进行土壤处理及种薯处理，230毫升/。
适宜区域：北方地区马铃薯生产区域。
旱地半膜垄沟深播技术
西北及华北西部属干旱和半干旱地区降雨量少、蒸发量大、水资源匮乏，对马铃薯生产造成了严重障碍。覆膜能有效地减少田间蒸发，垄面覆膜后可将垄面的降雨聚积于垄沟和垄侧，显著提高马铃薯根系土壤含水量。近年来，西北及内蒙古各省区研究总结出了不同方式的覆膜抗旱积雨新技术，并在生产中应用，取得了明显的增产效果。但也存在着费工费事，操作不便的缺点。综合全膜覆盖、半膜覆盖、垄侧播种，总结形成黑白两色膜垄上覆盖，垄侧深播技术。此技术比常规覆膜栽培增产20％以上。
本项技术要点：1.聚积垄面雨水，渗透到垄底马铃薯根系，充分接纳利用有限的自然降雨量。2.改全覆盖为只覆盖垄面，垄间播种沟便于追肥管理；还能使覆盖地膜、打孔、播种等多次作业为播种、覆膜、培土一次完成与全膜垄上栽培相比，省去了覆膜后挖窝点种和出苗时破膜引苗两道繁琐工序，节约劳动力，降低了成本。而且农艺技术简便，有利于小型农机具的研制和推广应用。3.改以往单一利用白色地膜实现增温、保墒，为根据播种季节、选择应用黑、白不同颜色地膜，实现调温、遮光、保墒效果，使用地膜更加科学合理。
地膜覆盖平作栽培方法
西南地区马铃薯种植一直沿用传统的塘播稀植方式种植，生产上普遍存在着种植密度稀、耕作层浅、偏施氮肥、不防治病虫害、管理粗放、产量低而不稳等问题。
通过多年的试验示范和不断改进完善，总结出马铃薯平播后起垄综合配套栽培技术。其要点是在采用优良品种的前提下，把深耕整地、脱毒良种小整薯播种、单垄单行密植平播、后期高垄培土、测土配方施肥、防治晚疫病、小型农机应用等技术组装集成起来综合应用。改变了传统粗放的种植方式，使单产得到了大幅度提高。
技术要点：1.选用脱毒良种。宣薯2号、凉薯14、川芋117、会-2等。2.平作起垄。平作播种，地膜覆盖，出苗后揭膜培土起垄。垄宽0.8米，垄高0.2米，沟宽0.4米。3.种薯处理。在播种前20天，催大芽至0.5-1厘米，切块后消毒，采取干拌消毒，2.5千克70％甲基托布津可湿性粉剂加2.5千克58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂和0.2千克72%的农用链霉素均匀拌入50千克滑石粉成为粉剂，每100千克种薯用2千克混合粉剂在切块后30分钟内均匀拌种。4.重施基肥，合理密植。一般每亩施腐熟农家肥1500千克+马铃薯专用肥50千克作基肥。密度5000-6000株，地膜覆盖比常规栽培可提前10天左右播种。5.除草盖膜。播种覆土后，亩用90%乙草胺100毫升全田喷雾后用1米的地膜覆膜，膜边用湿土压紧。
