油菜苗期主要病害是十字花科根肿病，俗称大根病，此病可对油菜造成毁灭性打击，其主要是种子带病毒和土壤传染，油菜一经感病即无药可治，病株必须连根拔出带离田间集中焚毁。其防治方法如下：
1、选择不带病毒种子；
2、合理轮作，减少病原。由于休眠孢子囊的抗逆性很强，因此发病严重的油菜田，要实行4-5年的轮作，在规定轮作的年限内不种油菜和十字花科蔬菜，可改种麦类和绿肥。
3、加强栽培管理。注意开沟排水，坚持深沟高畦，及时排除田间积水。
4、药物防治：根据相关报道，在十字花科根肿病的药物防治中，75％百菌清、福得帅、雷多米尔等药，防治效果达65%左右，用药成本比较高。而用80%多菌灵，通过拌种、结合施肥时药液与肥料灌根、每次防虫时，与杀虫药剂一起喷雾，防效在50-60%，而且用药成本比低，每亩成本不超过10元。
