甜玉米在生长期间可发生多种病毒病，较重要的有矮花叶病毒病、粗缩病毒病、花叶病等。
1、矮花叶病全生育期可染病，3叶期即可显症：心叶基部脉间出现椭圆形褪绿小点，沿叶脉排列成条点，叶肉失绿变黄，表现明显的条纹症，随后叶尖出现紫红色条纹，病株明显矮化，不及健株的1/2高，多数病株不能抽穗而早枯。病原称为玉米矮化病毒，病毒粒体长条状，可以通过汁液接触传染，自然情况下主要靠玉米蚜、麦二叉蚜、棉蚜、桃蚜等传播。寄主范围很广，除多种禾本科作物外，还可以侵染多种禾本科杂草。
2、粗缩病甜玉米出苗后即可染病，至5－6片叶时才显症，先在幼叶的脉间出现透明的褪绿小点，叶背主脉上长出小突起，病株叶色浓绿，节间缩短，高度只有健株的1/2－1/3，且分蘖多，根系发育不良。重病株雄穗往往不能抽出或无花粉，雌穗畸形不能结实或只有少数干瘪籽粒。病原称为玉米粗缩病毒，病毒粒体球形。病毒只能由昆虫传播，主要由灰飞虱和明飞虱传播。粗缩病毒的寄主范围也很广，除玉米外，还可危害57种禾本科植物，其中约有20种禾本科作物及田间许多禾本科杂草。
上述两种病毒都是在田间杂草寄主上越冬。第二年春季，躲藏在杂草寄主上越冬的蚜虫或飞虱转移到甜玉米地，通过昆虫的取食活动将体内的病毒传入植株体内引起发病。生长期还可以通过传毒昆虫不断的进行再侵染。
防治甜玉米病毒病可采取下述综防措施。
1、因地制宜选种抗耐病品种。
2、适当早播有一定的避病效果。
3、清除田边杂草、及时中耕除草可减少带毒寄主和传毒虫源。
4、治虫防病：必须在4叶期前，甚至玉米出苗期便开始治虫才能收到较好效果。
