为了克服温室连作障碍，每年的6月初至8月初为草莓温室种植空闲时期，也是草莓温室的消毒季。此时正处于夏季温度最高时期，光照最好，实施效果佳。目前，草莓种植除了传统的日光温室土壤栽培外，还有部分半基质栽培及高架栽培。现将每种种植模式的消毒方法介绍如下：
草莓日光温室土壤消毒
农户自主消毒以石灰氮为主，具体方法：
◆清洁温室将温室内上茬草莓收获后的遗留物清理干净，放置到远离种植区域的地方。
将稻草或麦秸（最好粉碎或铡成4-6厘米小段，以利翻耕）或其它未腐熟的有机物均匀撒于地表，亩用量600-1200千克，折合360-720千克/标准温室。然后，均匀撒施40-80千克/亩石灰氮，折合24-48千克/标准温室。
◆深翻用旋耕机或人工将有机物和石灰氮深翻入土壤，深度30-40厘米为佳。翻耕应尽量均匀，以增加石灰氮与土壤颗粒的接触面积。
◆做畦做高30厘米左右、宽60-70厘米的畦。做畦的目的是为了增加土壤的表面积，以利于快速提高地温，延长土壤高温所持续的时间，取得良好的消毒效果。
◆灌水从薄膜下往畦灌水，直至畦面湿透为止。保水性能差的地块可再灌水一次，但地面不能一直有积水。
◆密封用透明的塑料薄膜（尽量用棚膜，不要用地膜）将土壤表面密封起来。再将温室棚膜完全封闭，注意温室出入口、灌水沟口不要漏风。一般晴天时，20-30厘米的土层能较长时间保持在40℃-50℃，地表可达到70℃以上的温度。这样的状况持续20天左右，可有效杀灭土壤中多种真菌、细菌及根结线虫等有害生物。
◆打开棚膜，揭地膜高温闷棚20-30天后，打开温室通风口，揭开地面薄膜，翻耕土壤，充分曝气。
打开棚膜揭地膜7-14天后，施入生物修复菌剂（固氮、解磷钾、线虫等病虫害防治功能菌、腐熟菌类等），按照5千克/亩的用量施入，折合3千克/标准温室，可以与其它有机肥等作底肥翻入土壤，随即定植草莓。
注意问题
为充分发挥石灰氮分解过程中中间产物杀虫灭菌作用，应使土壤和石灰氮充分混合，保持土壤中足够的水分含量。保水性能较差的地块，应在处理过程中补充适量的水分。
密封性是决定土壤温度上升高低及快慢的主要因素之一，应经常检查塑料薄膜的损害程度，如有破损，必须及时修补。
处理过程中，如遇连续阴天或下雨，应适当延长处理天数。
操作时必须戴护眼罩、口罩、橡胶手套，身着长裤、长袖作业衣、无破损长靴，以免药肥接触皮肤。药肥（石灰氮）一旦接触皮肤，请用肥皂、清水仔细冲洗；如误入眼睛，立刻用清水冲洗，严重者应接受医生治疗。需要强调的是，操作前后24小时内不得饮用任何含有酒精的饮料。
草莓半基质栽培消毒
草莓半基质栽培与传统土栽和高架栽培相比具有多种优点，草莓日光温室半基质栽培模式的现在已经逐渐进入拉秧期，即将开始对基质和土壤进行消毒工作。现将半基质消毒方法介绍如下：
用剪子贴着草莓心茎，将地上部剪掉（不要剪得过低，避免过几天拔草莓主根时不好拔；也不要剪得过高，避免草莓还继续生长）。剪后几天，小须根就腐烂了，然后将草莓主根从基质中拔除扔掉。
栽培一年的，在基质表面均匀撒硫磺粉或五福或根泰，不浇水，用白色地膜盖严。靠水蒸气凝结到薄膜上的水使药剂均匀下渗。覆盖到定植前15-20天，去掉白色地膜，翻倒基质，避免基质过实。
栽培两年的，可以把基质铲出来，推到前棚脚，用水淋洗基质。然后在表面均匀撒硫磺粉、五福或根泰，再用白色地膜覆盖15-20天，去掉白色地膜，然后将基质回填，基质不够的要补充。
栽培1-2年的，基质槽下的土壤不用动。给回填后的基质浇水要用喷头，不要用滴灌，干燥的基质用滴灌无法完全渗透，用喷头浇透后再改用滴灌浇水。
栽培三年的，把基质清出来堆放在前棚脚，用高锰酸钾溶液喷淋基质，然后用白色地膜闷5-6天后回填。里边的土壤在清出基质后用五福或根泰均匀混合后浇水，用白色地膜覆盖进行高温消毒。
