加强田间综合管理要根据不同田块的土壤肥力、墒情、苗情（特别是每亩总茎数）和前期施肥情况等，分别采取不同的管理措施。基本原则是：弱苗以促为主，旺苗以控为主。以北方冬小麦的肥水管理为例：
对返青前每亩总茎数小于45万，叶色较淡、长势较差的三类苗麦田。应及时进行肥水管理，春季追肥可分两次进行。第一次在返青期，随浇水每亩追施尿素5～8公斤；第二次在拔节期随浇水每亩追施尿素10～15公斤。
对返青前每亩总茎数在45～60万之间，群体偏小的二类苗麦田。在小麦起身期，结合浇水每亩追施尿素10～15公斤。其中麦苗偏弱群体不足的麦田，可在起身初期至起身中期追肥浇水；群体适宜的麦田，应在起身后期追肥浇水。
对返青前每亩总茎数在60～80万之间，群体适宜的一类苗麦田。可在起身后至拔节期结合浇水每亩追施尿素12～15公斤。
对返青前每亩总茎数大于80万、叶色浓绿，有旺长趋势的旺苗麦田，应采取中耕镇压，减少氮肥施用，控制群体旺长，预防倒伏和贪青晚熟。
合理增施有机肥麦苗色相异常多与长期不施有机肥导致土壤中微量营养元素缺乏有关，或与有机肥施用方法不当导致幼苗不能正常生长有关。
冬小麦可以结合秋耕整地施用有机肥；春小麦播种较早，无深耕条件，可以在上一年秋收后，结合整地施用。一些干旱地区，可以将免耕或少耕覆盖技术与定期深耕或深松土技术相结合，以兼顾深耕失水和不耕无法施有机肥并改良土壤的矛盾。
秸秆还田是施用有机肥的另一种方法，应该大力提倡。但常因还田方法不当出现三种后果：一是整地质量不好或秸秆粉碎、掩埋不好，造成种子悬空，麦苗因得不到适量的养分和水分而枯死或发黄。二是秸秆还田未加施适量的氮肥，导致微生物与幼苗争夺养分；三是土壤干旱缺水限制了微生物对秸秆的的分解发酵。对此应该采取下列措施：1.用还田机将秸秆就地粉碎成不超过10厘米的小段，均匀抛撒于地面，再用圆盘耙或旋耕机旋耕，使秸秆均匀分布于0～10厘米土层中，提高整地和秸秆还田质量；2.在小麦正常施肥的基础上，每亩再格外加施2～4公斤的氮肥，调节秸秆的碳氮比；3.整地前适当灌水，调节土壤墒情。
建立田间档案对于农场和种植专业户还应该建立田间档案。内容包括当地的土壤、气候条件及其变化，种植的作物种类、主要管理措施、产品水平、病虫害发生和防治措施等。对这些资料（包括必要的照片）要用书面和计算机软件长期记载保存。
