西兰花花球的适收期短，并且采收后呼吸旺盛，不耐贮藏。在15-18℃温度下放置24小时花蕾即开始变黄，48小时花蕾开放，叶绿素只有采收时的50%，72小时花球全黄而失去食用价值。合适的贮藏条件和方法就显得非常重要。选择花球紧实，花球表面花蕾紧密平整，边缘花球略有松散，大小合适的贮藏。西兰花适合在温度0℃、湿度95-100%、氧气浓度1%-2%，二氧化碳浓度0%-5%条件下贮藏。贮藏方法有：
冷库贮藏：最常用的贮藏方法，根据贮藏数量可用菜架贮藏。
窖藏：周转筐上应用塑料膜覆盖，用以调节温度湿度。
假植贮藏：是指在入冬前，将未成熟的小西兰花连根挖起，假植在冷床、贮藏沟或设施内。
