玉米发生紫苗的原因很多，除生理因素外，其主要原因是土壤缺磷，土壤通气透水性差，低温。
一、是磷素不足，玉米碳水化合物的代谢受到破坏，因为叶片内积累的糖分过多，形成花青素，从而导致叶片变紫。应及时用根施通+磷肥灌根，诱导植株对土壤中氮磷钾及各种微量元素的吸收、消化，释放。
二、是土壤通气透水性差。由于地势低洼，积水受涝或地面板结，导致玉米根系发育不良，因而引起玉米幼苗发红或发紫。应及时中耕，除草，排积水提高土壤通透性。
三、是低温。玉米出苗后，如遇到低温，也常常会使玉米叶片变红或变紫。应在出苗后及时喷施新高脂膜形成一层保护膜，保温防病菌侵染。
