1、剥壳催芽
（1）剥壳
采用镊子和刀片，垫块小木板，逐粒剥切种子果皮，要一边剥一边切，取出果皮内的完好菠菜种子。剥好的菠菜种子可催芽或直接播种。
（2）催芽
对发芽用的器皿、纱布、滤纸用沸腾放入热开水进行。采用发芽皿，底层垫脱脂纱布，再铺4层滤纸，把剥好的种子均匀排列在滤纸上，上面再盖2层滤纸，浇适量水，贴上标签，在20-25℃黑暗条件下发芽。
（3）检查处理
剥壳发芽管理关键在于温度和水分。试验前3天温度宜高，在25℃下催芽、20℃恒温发芽较好。芽床水分以保持在手压不出水为宜。发芽开始后要认真检查记录，发现霉烂应立即除掉，防止传染。
2、低温处理
用凉水浸种12-24小时，待果皮发黑时捞出，滤去多余水分，放在4℃的冷库或冰箱冷藏室里处理24小时，然后在20-25℃条件下催芽；也可将浸种后的菠菜种子吊在水井的水上面催芽。3-5天出芽后即可播种。
3、过氧化氢溶液处理
过氧化氢浸种能有效除去菠菜种子表皮的胶质层，提高菠菜种子的发芽率，使菠菜播后出苗快且整齐。
方法是：将过氧化氢溶液按1:4比列兑水，经搅拌配制成20%-25%过氧化氢水溶液。将配制好的过氧化氢水溶液盛于容器中，倒入种子时应边倒边用木棒搅拌，使种子都能均匀吸水。当气温低于20℃时，浸种时间需100-120分钟；气温高于20℃、低于30℃时，浸种时间60-90分钟；气温高于30℃时，浸种时间30-50分钟即可。
种子催芽浸种后将菠菜种子从过氧化氢水溶液中捞出，随即用清水冲洗3-4次（边冲边滤水），滤水后盛于容器中用湿布巾覆盖催芽。若种子成熟适度且饱满，一般5-天就有85%以上的菠菜种子发芽，播种后2-3天即可出苗，比常规播种提前6-8天出苗。
用过氧化氢溶液浸种处理前，应把自留或购买的菠菜种子选择晴天太阳下晒4-6小时，并剔除杂物和不饱满的菠菜种子，用百菌清水溶液对已经浸种催芽的菠菜种子进行处理，浸种催芽处理后的菠菜种子应及时播种，大田（大棚）土壤要求湿润，播种后覆土1-1.5厘米并加压，使土壤与菠菜种子吻合，再用稻草帘覆盖，待有10%-15%的幼苗出土时将草帘掀开。
