一、选用抗病苦瓜品种。
二、苦瓜种子播种前先用55-60℃的温水浸种20分钟后再选用40%甲醛150倍液浸种30分钟，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸种1小时后捞起用清水冲洗。
三、整地时翻土暴晒5天-7天，让土壤充分晒白风化。每亩施石灰5O千克-75千克，中和土壤酸性和抑制病菌生长。
四、高温多湿容易发生枯萎病，采用高畦深坑种植法，降低地下水位，防止雨后积水，使畦面土壤通风，可减少病害。
五、苦瓜播种前种子先消毒，再把苦瓜、丝瓜种子播在营养钵中，待丝瓜长出3片真叶时，采用舌接法把苦瓜苗切断接入丝瓜切口处，伤口愈合后剪断丝瓜枝蔓，待苦瓜长出4片真叶时再定植。
六、苦瓜与非瓜类作物合理轮作，及时清除病残体多施充分腐熟的有机肥，避免偏施化学氮肥。保护地种植应注意棚室的温湿度调控，露地种植也要注意通风降湿，有条件的可采用地膜覆盖，尽量降低环境湿度。
