无籽西瓜伸蔓后根系发达，茎叶生长旺盛，需肥数量比二倍体普通西瓜多。一般亩施土杂肥4000-5000公斤，饼肥60-80公斤，过磷酸钙40-50公斤，硫酸铵50公斤或尿素30公斤，硫酸钾25公斤。土杂肥和磷肥做基肥沟施或穴施，其他肥料做追肥分3-4次施用。
无籽西瓜苗期生长缓慢，伸蔓后生长加快，到开花坐果期生长势更加旺盛，这时如果肥水供应不当，很容易造成徒长跑秧，难以坐果。因此，从幼苗“甩龙头”后到目的节位的雌花开花前应适当控制肥水。浇水以小水暗浇为宜。坐果后5-7天，幼果鸡蛋大小时，应加大肥水供应量，肥水齐攻，促进果实迅速膨大。
