该病主要为害幼果或成长中的果实。幼瓜染病，病部先呈褐色水浸状，后迅速软化腐烂如泥。该病扩展速度很快，有些病瓜从发病到整果腐烂仅几天时间，有些幼瓜今天发病，24小时后即见烂掉，病瓜散出臭味是识别该病的重要特征。
防治方法：
1、选用抗病包衣的种子，如未包衣，则用拌种剂或浸种剂灭菌。
2、避免与白菜类蔬菜连茬，前茬选择最好是葱蒜类或茄果类蔬菜。
3、整地前必须用生石灰或高锰酸钾进行土壤消毒，生石灰667平方米用量为50-100千克，高锰酸钾用量为2-2.5千克。
4、采用黑籽南瓜作砧木进行嫁接栽培，促使植株根系强大，耐低温能力提高，抗病性增强。
5、合理施用氮肥，增施磷钾肥。
6、注意灌水，有条件的采取膜下滴灌，避免大水漫灌，雨后及时排水，避免田间积水
7、加强其它病虫害的防治，整个生育期主要做好白粉虱、蚜虫危害的防治。
8、农事操作要仔细，避免机械损伤，可适当加大行距，缩小株距，这样有利于田间操作。整枝打权应选择晴天的中午进行，将整掉的侧枝及病叶、老叶及时运出田园，保持田园清洁。
9、发现病瓜及时摘除深埋，病瓜上面撒施生石灰消毒。
10、药剂防治西葫芦定植时、整枝打杈前用药剂预防；在软腐病发病初期开始，选用77%可杀得可湿性粉剂500倍液、47%加瑞农可湿性粉剂700倍液等喷洒、72%农用链霉素可溶性粉剂3000～4000倍液等喷洒，每隔7天交替喷雾一次，连续防治2—3次。
