葛根抗病虫害的能力很强，一般很少发生病虫害。有时会有轻微的黄粉病、根腐病、蛀心虫、蝽蟓、蝗虫、蚜虫、松毛虫等危害，对产量品质影响不大，可以不必专门防治。若要防治，害虫可人工捕杀或选用普通的高效低毒杀虫剂防治，如敌杀死、敌敌畏、乐果等。病害可选用甲基托布津700倍液、退菌特800倍液或多菌灵可湿性粉剂800倍液防治。但来自土壤的虫害，却是要加以重视的。土蚕、黄蚂蚁对幼苗成活和葛根的产量品质影响极大，不可不防。我们在开挖种植沟时就要人工捕杀土蚕，结合施底肥回填土时，就要施用土壤杀虫农药毒杀害虫。在葛根生长期，可选用5%辛硫磷颗粒剂或3%呋喃丹颗粒剂施入土壤毒杀。另外，葛根有甜味，老鼠特别爱吃，因此，也要注意鼠害防治。
