①轮作倒茬。重病地改种小麦、玉米5年以上.
②种植抗病品种。在抗萎病程度上，品种间存在较大差异。有些品种如GK-12，在抗萎性上表现良好。另外，早熟品种抗性较低，应选用生育期较长的品种。
③减少种子带菌机会。不要用毛籽作为种子，要用硫酸脱绒的种子及包衣的种子。
④选用籽粒饱满的种子。
⑤秋耕深翻，破坏犁底层，增强土壤透气性。
⑥勤中耕，破坏土壤板结，及时散墒提温。
⑦在棉花生长前期，有条件的地方可在田地中铺设1寸厚的麦草或稻草，防止下雨后土壤板结，可使土壤保持疏松，减轻病害。
⑧在蕾、铃期及时喷洒缩节胺等生长调节剂，可减轻病害。
⑨平衡施肥，增强棉株自身抗性。在棉花生长后期，因为后期根系感病，营养吸收受阻，此时应进行多次根外追肥，抗虫棉注重多施钾肥。
