为了赶茬口，抢时间，很多菜农上茬蔬菜还未清园，下茬蔬菜已经定植，即采取套种模式。与正常换茬模式相比，套种模式下能保证下茬蔬菜提早上市。优势明显，但也有劣势，那就是生长中后期的植株，管理粗放，病害发生多，而幼苗抗性差，很容易感染病害。因此，套种蔬菜在管理时，一定要做到大小兼顾，才能充分发挥其优势。那么，在管理上，应注意哪些方面呢？
提高植株间通透性，尽可能让幼苗多见光。目前，西红柿和彩椒套种较多，以西红柿套种为例，幼苗定植时，上茬西红柿已进入采收末期，一般仅剩上部1-2穗果处于膨果后期或转色期。为保证新定植幼苗的见光，需要及时摘除西红柿上没有果实的主枝及果实下部的叶片，但需保留果实上部的叶片，确保果实营养供应及防止果实皴裂等问题。
把握喷药技巧，避免幼苗产生药害。套种模式病害难防，原因有三，一是上茬西红柿未拔园，许多病果、残枝遗留在土壤中，病菌大量繁殖，待幼苗套种定植后，这些病菌随之侵入或潜伏。二是幼苗在相对不利的环境中定植，缓苗慢，根系弱，植株的抗病能力较差，再加上农事操作不当造成伤口，就会给病菌以极大的可趁之机，尤其是细菌性病害。三是深冬换茬，低温寡照，浇水后棚内湿度大，适宜病菌的快速繁殖。用药时，上茬植株病害以治疗为主，而幼苗却应以预防为主，前者用药浓度较后者大，若连续用药易让幼苗产生药害，因此，在病害防治上，幼苗定植前，上茬植株应加强预防工作，目前重点预防细菌性病害和根部病害。幼苗定植后，针对根部病害，以根腐病为主，套种幼苗移栽后需定期药剂灌根。建议定植后2-3天，使用普力克混恶霉灵喷淋灌根；缓苗后再用多菌灵混适乐时喷淋灌根；进入结果期之前，再灌一次。这样连续灌根三次，基本可保证苗期不会发生根部病害。针对细菌性病害，每隔15天喷施一次中生菌素或者铜制剂进行预防。需要提醒的是，在上茬作物拔园之后一定要马上喷施一次。
合理管理保温被及放风口，调控好棚内温湿度。此时既要考虑果实的转色，又不可忽视下茬蔬菜缓苗。白天温度应控制在25-28℃，夜间温度在15-18℃为宜，这样不会影响转色，也有利于缓苗。
清园后，加强幼苗的肥水管理。上茬蔬菜拔园前，应提前2天进行浇水，保持土壤湿润，便于拔出植株，减少土壤中残留根系。拔园后做好枯枝烂叶的清理工作，以降低棚内病虫害基数。更重要的是，上茬蔬菜拔园后，应及时在种植行中施肥，以包施或穴施为主，并浇水、划锄，改善土壤透气性。
