菠菜炭疽病主要危害叶柄，也危害花梗和种荚，病害通常从基部叶片开始发生，初产灰白色水渍状小点，后扩大为灰褐色病斑。防治这种病害，要从种植做起。
选种与种子处理。从无病留种株上采收种子，引进商品种子在播前要做好种子处理。用52℃温水浸种20分钟后，立即移入冷水中冷却，晾干后催芽播种。
轮作栽培。发病地块提倡与其他蔬菜实行2~3年轮作，以减少田间病原菌。
加强栽培管理。深沟高畦栽培，适当密植，施足有机肥，合理灌水，降低田间湿度，提高植株抗病力。
清理田园。收获后及时清除病株残体，并带到田外深埋或烧毁，可减轻发病。深翻土壤，加速病残体的腐烂分解。
化学防治。
发病初期，及时用农药防治，连续喷雾防治2~3次，用药间隔期7~10天。药剂可选用：80%山德生可湿性粉剂600~800倍液（亩用药量150~180克）、70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液（亩用药量100克）、75%百菌清可湿性粉剂600倍液（亩用药量165克）、70%代森锰锌可湿性粉剂600倍液（亩用药量165克）、50%多菌灵可湿性粉剂800倍液（亩用药量125克）、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液（亩用药量200克）等。
防治菠菜炭疽病，与防治为主，做好防治工作，确保高产，质量高。
农业防治：
1播种或移栽前，或收获后，清除田间及四周杂草，集中烧毁或沤肥；深翻地灭茬、晒土，促使病残体分解，减少病源和虫源。
2育苗的营养土要选用无菌土，用前晒三周以上；
3和非本科作物轮作，水旱轮作最好。
4选用抗病品种，选用无病、包衣的种子，如未包衣则种子须用拌种剂或浸种剂灭菌。
5育苗移栽，播种后用药土覆盖，移栽前喷施一次除虫灭菌剂，这是防病的关键。
6适时早播，早移栽、早培土、早施肥，及时中耕培土，培育壮苗。移栽时汰除病、弱苗。
7选用排灌方便的田块，开好排水沟，降低地下水位，达到雨停无积水；大雨或大雪过后及时清理沟系，防止湿气滞留，降低田间湿度，这是防病的重要措施。
8土壤病菌多或地下害虫严重的田块，在播种前撒施或沟施灭菌杀虫的药土，
9施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟的有机肥，不用带菌肥料，施用的有机肥不得含有本科作物病残体。
10采用测土配方施肥技术，适当增施磷钾肥，加强田间管理，培育壮苗，达到“冬壮、早发、早熟”，增强植株抗病力，有利于减轻病害……
11及时防治害虫，减少植株伤口，减少病菌传播途径；发病时及时清除病叶、病株，并带出田外烧毁，病穴施药或生石灰。
12高温干旱时应科学灌水，以提高田间湿度，减轻蚜虫、灰飞虱危害与传毒。严禁连续灌水和大水漫灌。浇水时防止水滴溅起，是防止该病的重要措施。
