棉花蚜虫的防治以农业防治和生物控制为主，化学防治为辅，防治应根据发生情况因地防治，点片发生时应挑治，不要满田喷药，以免杀死天敌。对达到药剂防治指标的田块应及时进行化学防治。
1、防治指标苗蚜百株3叶蚜量2500头或以出现卷叶株为防治指标，伏蚜平均单株上、中、下3叶蚜量200头作为防治指标。棉蚜发生达到防治指标时正处于点片危害阶段，应进行局部针对性喷雾，避免大面积用药。
2、农业防治实行棉麦轮作，利用小麦屏障作用阻止有翅蚜向棉田迁飞，又便于麦株的天敌向棉株转移，加强了棉田的调节自控能力。七星瓢虫、草蛉等为蚜虫的天敌，当天敌总数与棉蚜数为1：40时，基本可以控制其危害，天敌较少蚜虫数量大时应及时开展化学防治。
3、化学药剂防治目前进行防治棉蚜的普通用法就是进行药剂防治，化学防治应掌握高效、低毒、交替用药的原则，通常都在用吡虫啉和啶虫咪等烟碱类产品进行防治棉蚜，但是要注意的是，随着常规用药年限的长久，防治效果也越来越不理想，部分地区已经完全没有效果，棉蚜繁殖发展迅速，极易产生抗药性。1）前期蚜虫发生较轻时，加强田间管理，铲除杂草，加强水肥管理，促进棉苗早发；结合间苗、定苗拔除有蚜株，并带出田外集中烧毁。再就是进行药剂防治，可选用啶虫眯、吡虫啉等具有胃毒和触杀作用的药物交替使用。棉苗3片真叶前，当卷叶株率达5%～10%时，4片真叶后卷叶株率达10%～20%时，用10%吡虫啉可湿性粉剂每亩15克对水30公斤均匀喷雾，或10%啶虫脒乳油3000倍液，或20%啶虫脒可湿性粉剂1500～2000倍液，或20%丁硫克百威乳油2000～4000倍液或40%毒死蜱乳油1000-1500倍液等药剂叶背面常量喷雾，喷雾时要以棉苗心叶为重点并注意翻转喷头向叶背喷，要注意药剂的混合使用、轮换使用，喷药要均匀周到，7天后再防治一次，以提高防治效果。同时每亩加50%的多菌灵可湿性粉剂1000倍液或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍等药剂喷雾防治炭疽病和立枯病。2）对于后期的蚜虫，要注意选择具有内吸性的药剂。一般选用35%赛丹乳油每亩100-160毫升、或25%氧乐氰乳油每亩50-100毫克、或蚜虫专用杀虫剂(5%啶虫·高氯乳油)每亩25-30毫升、或4.5%氯氰菊酯乳油每亩25-50毫升，以上药剂每亩兑水50公斤交替喷雾使用，以免产生抗药性，喷时应喷头朝上，注意喷洒叶背面。
四、化学药剂防治蚜虫时用药的一般原则1）消灭埂边及棉田内的杂草；2）喷药时，连同杂草一同喷施；3）注意点片防、点片治;4）用不同有效成分的药剂混合使用；最好使用触杀性和内吸性的药剂，速效性和持效性的药剂混合使用;5）轮番使用药剂。同一种药剂最多使用2次，避免产生抗性。将啶虫脒、吡虫啉、毒死蜱等田间常规药剂轮换使用，降低蚜虫产生抗药性的可能性，一旦蚜虫对某一种化学药剂产生抗药性，即使再增加用药次数，增大药剂浓度，也不会达到理想的防治效果。一般啶虫眯防效较好，不易产生抗性；吡虫啉对棉蚜已有抗性。6）保护天敌。用药时选用选择性药剂，一定要注意保护天敌，尤其注意在5月30日以后。7）将发生部位喷匀打透。因为蚜虫繁殖速度快，如果一次喷不透会造成残虫数量多，给下次防治增加难度，所以防治蚜虫喷药时一定要仔细认真，着重喷洒棉花中下部叶片背面，严防漏打、漏喷，切实保证每次喷药质量，做到“低浓度、足药液，喷匀打透，不漏棵、不漏叶”，根据虫情7-10天防治一次，连续喷药2-3次，施药时间应避开日头高温天气为宜，尽量在早、晚用药，一方面可确保人身安全，另一方面可避免高温造成药液快速蒸发散失，降低药效。8）提倡选用部分新药。对常规使用啶虫脒、吡虫啉等传统药剂防治效果不明显的地块，可以用10%氯噻啉等新型药剂来防治。一般10%氯噻啉可湿性粉剂每亩20克或10%烯啶虫胺水剂每亩20毫升。
