辣椒苗期主要猝倒病、立枯病。防治可用敌克松兑水浇苗床防治；大田上主要有病毒病、青枯病、根腐病、疫病、炭疽病、顶枯病、细菌性叶斑病防治可依致病的病原菌分别治疗，细菌类的可用70%的农用链霉素4000倍液喷雾或可杀得2000可湿性粉剂500倍液喷雾。真菌类的可用太抗枯草芽孢杆菌200-300倍液喷叶和灌根2-3次。病毒类的在防治时采取杀死蚜虫的同时结合叶面肥和20%的病毒A可湿性粉剂500倍喷雾，7天喷一次连喷2-3次。虫害主要有蚜虫防治用蚜克星乳油1000-1500倍液喷雾。其次是棉铃虫，防治可用天王星2.5%乳油3000倍液喷雾。
