（1）菌蛆：主要危害菌丝体或子实体。菌蝇、蚊等的幼虫都是白色或黄色没有脚的小蛆，会蛀食子实体。防治办法：清除衰老的菌丝体；利用成虫趋光性，设杀虫灯进行诱杀，或喷高效低毒农药，如敌百虫1000倍液喷射，能杀死幼虫和虫卵。
（2）菌螨：属于蜘蛛纲、蜱螨目的一些小虫，个体很小，黄白色，成堆时是淡黄褐色，像灰尘或米糠，繁殖力很强行动迅速，会吃菌丝和菌盖，造成菇蕾枯萎。防治：原料充分晒干，周围环境喷敌敌畏，发生后用4％三氯杀螨醇乳剂800倍液喷洒。（3）跳虫：成虫有灵活的尾部，弹跳如蚤，咬食子实体。防治方法：喷洒0.1％的鱼藤精。还有一些害虫如古语蛄蝓、蚂蚁、蟑螂、蝼蛄等，防治时可在地面撒些生石灰。
