1.选用抗耐病品种，是控制赤霉病为害最经济有效的措施。在当前推广的小麦品种中，以鲁麦14号、烟农15较抗赤霉病。
2.深耕灭茬，清除病残体，适期播种，合理施肥、浇水，避免大水漫灌等栽培措施，降低农田小气候的湿度，创造不利于病害发生的生态环境是防治赤霉病的一项基础措施。
3.药剂防治。在长江中下游，喷药时期往往阴雨连绵或时晴时雨，必须抢在雨前或雨停间隙露水干后抢时喷药，喷药后遇雨可隔5～7天再喷1次，以提高防治效果。防治方法为每亩用50%多菌灵可湿性粉剂100克或70%甲基托布津可湿性粉剂50—75克加水50—75公斤常量喷雾。可隔5～7天再喷1次，喷药时要重点对准小麦穗部，均匀喷雾。
