1、加强栽培管理根据品种特性，适当密植；采用高畦地膜覆盖栽培，采用滴灌或膜下浇水控制棚内湿度，浇水应选择晴天上午进行，浇水后闭棚体温，在中午和下午再将水汽放掉，降低田间湿度，控制灰霉病的发生与侵染。
2、及时摘除残花和病残体在发病初期摘除含有病斑含有病斑的花瓣、柱头、病果、病叶，防止病原菌进一步扩散到其他部位。在蘸花后10~15天，摘除幼果残留的花瓣和柱头，部分染病的幼果应及时去除，降低病菌的初侵染点，从而达到防治茄子灰霉病的发生。同时，发病初期要摘除病叶、病果，并带出棚室烧毁或深埋，严防乱扔，人为传播。
3、调控棚室温室环境灰霉病属低温高湿病害，可以通过管理措施来降低温室内叶片和果实的着露量和着露时间，预防灰霉病的发生。一般采用“上午控温、下午控湿”的方法，在晴天上午棚温升到30℃时放风，中午和下午继续放风，控制棚温在23℃左右，降低湿度。当棚温降低到20℃时关闭大棚，使夜间温度保持在15℃。
4、化学防治（1）点花时用药在配好的2,4-D或防落素稀释液中，加入0.1%浓度的50%腐霉利或50%异菌脲可湿性粉剂，然后再蘸（喷）花，能有效防控灰霉病从花器感病。（2）药剂防治茄子灰霉病的控制主要还是依赖化学防治，在发病初期，可用50%啶菌·乙霉威水剂1500倍液，或25%啶菌噁唑乳油1500倍液，或42.4%唑醚·氟酰胺悬浮剂2500倍液喷雾防治。茎秆发病时，可将药剂原液用面粉调成糊状涂抹在茎杆病斑上，能有效治疗该病的发生。如果棚内湿度较大，可采用烟熏法防治，可选用40%百菌清烟剂或10%腐霉利烟剂200克每亩，均匀分散在各处点燃，在傍晚闭棚前熏施。该病一般以花期和坐果期为重点防治时期，采用喷雾施药，要注意及时通风排湿，药剂防治茄子灰霉病要早，不能太晚；由于灰霉病菌易产生抗药性，要注意交替轮换用药或药剂混合使用，有利于提高防效，延缓抗药性。
