大葱小菌核病的病原菌是小菌核菌，它是一种真菌。这种真菌一般生长在土壤中，而葱根则是其主要寄主。因此，如果土壤中的小菌核菌数量过多，就会导致葱根感染，从而引发大葱小菌核病的发生。
环境因素也是导致大葱小菌核病发病的重要原因之一。例如，高温、高湿、强光等条件都会使得小菌核菌的繁殖速度加快，从而增加感染的概率。此外，如果葱田里土壤的pH值过低或者过高，也会对葱根的生长带来影响，导致其易受感染。
还有一些种植管理方面的问题也会影响大葱小菌核病的发生。例如，葱田里的积水、肥料过多、土壤通风不良等都会对葱根的生长带来不利影响，增加感染的概率。此外，种植过程中如果不注意杂草的清除，也会对葱根的生长造成影响。
