南瓜的施肥应该选择有机肥料。有机肥料是指来源于动植物或者人工合成的有机物质，其成分稳定、营养丰富、不含有害物质。使用有机肥料施肥，不仅可增加土壤肥力，提高农作物产量，而且还能改善土壤环境，减少化学肥料对环境的污染。
南瓜的施肥应该根据生长期进行分期施肥。南瓜生长期分为苗期、生长期、开花期、结果期，不同生长期对养分需求也不同。在苗期，可以适量施用腐熟的有机肥料；在生长期，可以适量施用含氮、磷、钾等元素的有机肥料；在开花期和结果期，可以适量施用含磷、钾等元素的有机肥料，有助于南瓜的开花结果。
南瓜的施肥应该遵循循环利用原则。南瓜生产过程中产生的粪便、秸秆等有机物质可以通过堆肥堆肥或者腐熟后再利用，为下一次的南瓜生产提供肥料。这样不仅可以减少有机废弃物的排放，而且还可以减少肥料的使用，降低生产成本。
