果实是炭疽病的重要目标。炭疽病的症状为橙黄色至暗褐色的小圆点，患处表面凹陷，颜色变深后逐渐扩大，形成黑褐色的斑点，当果实受到侵染后，会烂熟脱落或变形变质，导致柑橘产量和质量的大幅下降。
叶片也是炭疽病的主要部位之一。病害初期，叶片表面出现小圆点，逐渐扩大形成深褐色斑点，边缘皱缩，中心部分凹陷，形成小孔或撕裂，从而影响柑橘的光合作用和营养代谢，进而影响柑橘的生长和发育。
枝干也容易受到炭疽病的侵害。炭疽病的症状为长形或圆形的小黑点，逐渐扩大形成黑褐色病斑，感染严重时，会导致柑橘的枝干枯死，影响柑橘的整体生长。
花芽也是炭疽病的重要部位。当花芽受到感染时，会出现深褐色的病斑，影响花芽的正常发育，导致花期和果实产量的减少。
