萝卜黑腐病通常会从根部开始侵染，随着时间的推移，病害会逐渐向上蔓延，直到影响到整个植株。因此，萝卜的根部是黑腐病最主要的危害部位。当萝卜被黑腐病侵染后，根部会出现软腐、坏烂和黑色的现象，这会导致萝卜的生长受到限制，同时也会影响到其品质。
除了根部，萝卜的叶子也是黑腐病的危害部位之一。当病害发展到一定程度时，萝卜的叶子会变得黄色，并且出现枯萎和死亡的现象。这不仅会降低萝卜的光合作用能力，还会影响到其生长发育。
此外，黑腐病还会危害萝卜的花部和果实部分。当病害侵染到这些部位时，会导致花部和果实变得枯萎、干瘪和变黑，严重的话甚至会脱落。这对萝卜的产量和质量都会造成影响。
