金秋沙糖桔是一种喜酸性土壤的水果，因此在施肥时应选用酸性肥料，以帮助调节土壤酸碱度，提高土壤肥力。比较适合的肥料有硫酸铵、硫酸钾、尿素等。
金秋沙糖桔在果实成长期需要大量的氮、磷、钾等元素。其中，氮元素是促进果实生长的关键元素，因此在施肥时应适量增加氮肥。磷元素则有助于提高果实品质和抗病能力，钾元素则能够提高果实的甜度和硬度。因此，在施肥时应分别选用含氮、磷、钾的复合肥或分别施用氮肥、磷肥、钾肥。
此外，金秋沙糖桔在生长期还需要适量的微量元素，如铁、锌、锰等，而这些元素在土壤中含量较少，因此需要通过施肥来补充。比较适合的微量元素肥料有硼肥、锌肥等。
