微耕机的保养应按使用说明书要求的时间间隔进行，尤其在恶劣工作条件下应增加保养次数。
每天或每工作5小时应检查机油油面。首次更换机油在20小时，第二次在48小时，之后每70小时更换一次。重负荷作业或高温环境下应及时检查更换机油，并清洁火花塞检查其打火情况。
每工作50小时应清洗保养空气滤清器滤芯，如滤芯太脏或损坏应及时更换。每100小时清洁或更换火花塞，并检查或更换减速器中的机油。
随时清除发动机、排气管、散热片上的灰尘和赃物，以防发动机过热。存放微耕机时，应放空燃油系统中的燃油，防止燃油胶质。取下火花塞，向缸筒中加入约15ML干净机油，慢慢转动曲轴，使各运动部件之间布满机油。
微耕机应存放于干燥、通风并远离火源、电源的地方。