基肥柴胡适应性较强，喜欢冷凉湿润的气候，应选择土层深厚，疏松肥沃的沙质土壤为好。3月下旬，在选好的地块里，最好施用有机肥，坚持以农家肥为主化肥为辅的施肥原则，一般亩施优质农家肥2500-3000千克，二铵10~15公斤，或磷钾复合肥20~30公斤。充分均匀的撒施以后，进行深翻30厘米以上，然后做畦。
苗期施肥柴胡用种子繁殖，一般在4月中旬播种。柴胡生长分为3个时期：
1、根茎开始生长期：4月中下旬-7月上旬；
2、根茎发育盛期：7月中旬-9月下旬；
3、生长末期：10月上旬-11月中下旬；
柴胡种子一般播种后15天，畦面萌发针叶，幼苗期要保持土壤湿润，在苗高5-7厘米时，需要追施氮肥1-2次，在行间开沟施入。
生长期施肥
7月份是柴胡需要养分和水分的第一高峰期，为了满足植株的需要，每亩施尿素10-12公斤；过磷酸钙10-15公斤；硫酸铵5-7.5公斤；或兼施一些油质肥料，可在行间开沟施入。
8月份植株生长出现抽薹现蕾现象，对生产中药材为主，不做留种田的地块，在柴胡花蕾发现以后，要及时摘取花蕾；还要及时除去多余的丛生茎芽，以促使根部迅速生长，提高产量和质量。在打顶以后要及时追肥，以尿素为主，每亩用量10公斤；追肥后要浇水。
10月份是种子成熟季节，一般不进行施肥。
