我国各棉区病虫危害是影响棉花产量和品质的重要因素，2016年，棉蚜、棉盲蝽、棉叶螨、棉铃虫、苗病、枯萎病、黄萎病、铃病等病虫将在各棉区普遍发生，棉蓟马、斜纹夜蛾、烟粉虱和红叶茎枯病等偶发性病虫将在不同棉区发生。
一、精心管护存量秧苗
1.黄河流域棉区：包括河北、山东、河南、天津、山西和陕西棉区。重点防控棉盲蝽、棉蚜、棉叶螨、棉铃虫，预防枯萎病、黄萎病、苗病、铃病、红叶茎枯病，局部做好地下害虫（蝼蛄、蛴螬、金针虫、地老虎）、棉蓟马、象鼻虫、细菌性角斑病的防治。
2.长江流域棉区：包括江苏、安徽、湖北、江西和湖南棉区。重点做好棉盲蝽、棉叶螨、棉铃虫、斜纹夜蛾、枯萎病、黄萎病的防治，预防苗病、铃病、红叶茎枯病，注意防治棉蚜、红铃虫、棉蓟马、烟粉虱等。
3.西北内陆棉区：包括新疆、甘肃棉区。重点做好棉叶螨、棉蚜、棉铃虫、棉蓟马、棉盲蝽、烟粉虱、枯萎病、黄萎病、苗病的防治。
二、主要技术措施
1.播种期
预防对象：
苗病、苗蚜、棉叶螨、棉盲蝽、枯萎病、黄萎病等。
（1）选用抗（耐）病虫品种和包衣棉种，做好种子药剂处理。选用吡虫啉、噻虫嗪种子处理剂与枯草芽孢杆菌等杀菌剂混合再包衣，预防棉盲蝽、棉蚜、苗病、黄萎病。
（2）选择避风向阳、地势较高、排水方便田块作苗床，选用土质肥沃、无枯萎病和黄萎病菌土壤制钵育苗，培育壮苗。
（3）清除棉田内和田埂、路边杂草，减少棉盲蝽、棉叶螨虫口基数。
2.苗期
防治对象：苗病、苗蚜、棉叶螨、棉盲蝽、棉蓟马、地下害虫、枯萎病、黄萎病等。
（1）小麦、油菜收获后推迟灭茬，秸秆在田间堆放2～3天，使天敌充分向棉株转移，以益控害。
（2）苗病：遇低温阴雨天气时，及时喷施枯草芽孢杆菌、多抗霉素、甲基硫菌灵、噁霉灵等药剂预防。
（3）苗蚜：长江流域棉区以自然天敌控害为主；黄河流域和西北内陆棉区直播棉3片真叶前，当卷叶株率达5～10%，或4片真叶后卷叶株率10～20%时，及时药剂防治。
（4）棉叶螨：黄河流域和西北内陆棉区有螨株率低于15%时挑治中心株，超过15%时普治。
（5）棉盲蝽：长江流域棉区棉苗营养钵移栽前施好送嫁药。大田百株若虫量达到3头时，进行药剂防治。
（6）地老虎：采用昆虫性诱剂诱杀成虫，压低基数。采用晶体敌百虫配制毒土或毒饵顺垄条施诱杀幼虫。
（7）枯萎病、黄萎病：疏通“三沟”（围沟、横沟、厢沟），增施钾肥，选用碳酸氢铵作追肥，药剂防治初发病株。