高粱镰刀菌穗腐病主要为害穗部，也可为害叶片、茎秆：穗部受害，花序发病时谷粒上生出白色至粉红色菌丝，产生粉状物。叶片上的病斑为褐色至紫红色，发病严重时叶片萎蔫，长出粉红色霉层。茎秆发病部位多在基部第1—3节，可以引起植株萎蔫。
【病原与发生规律】称串珠镰孢，属半知菌亚门：有性态为Gibberellafujikuroi称藤仓赤霉，属子囊菌亚门。病原以菌丝体在病组织或遗落土中的病残体上越冬，也可附着在种子上越冬。第2年产生分生孢子，借风雨传播引起发病，后病部产生新的分生孢子进行再侵染。低温高湿是该病发生较为有利的因素，昼暖夜凉的天气有利于发病。多发生在高粱开花后子实成长期。
【防治方法】施用的有机肥要腐熟，增施有机肥，氮、磷、钾肥合理搭配。
药剂防治：初花期喷施下列药剂：70％甲基硫菌灵可湿性粉剂800—1000倍液；50％多菌灵可湿性粉剂800倍液；50％苯菌灵可湿性粉剂1500倍液；65％甲·霉灵（甲基硫菌灵·乙霉威）可湿性粉剂1000倍液；50％多·霉威（多菌灵·乙霉威）可湿性粉剂800倍液。