随着温差加大，气温开始下降，土壤湿度增大，当前部分棉田较普遍地发生了黄萎病，而且有加快蔓延和加重发展之势。症状表现多样化，还有的和枯萎病混发，很难区分开。现在多数棉田发病程度还不太严重，病叶出现在中下部和少数棉株；但少数地块病情严重，有的甚至叶片和花蕾开始脱落或突然萎蔫死亡。这样的地块大多为多年连作又不施有机肥、瘠薄缺肥地、严重缺钾地、低洼粘湿地、整地粗放或除草剂为害致使根系发育不良、中下部结铃多没有及时补充营养的地块。症状出现在8月份，但根源却是前中期管理不当造成的。
目前还没有对黄萎病免疫的棉花品种，只是抗耐程度不同。随着棉株的进一步衰老，最终棉花黄萎病的发病株率几乎都是百分之百，但只要是发病较晚而且局限在下部叶片，对棉花产量不会造成什么影响。当前抗耐黄萎病的品种不少，只要采取综合措施保持棉株体质健壮，对棉花黄萎病是不难控制的。这些措施包括：保持较深的耕作层、安全使用除草剂、施足底肥，使根系健壮发育；增施有机肥，增加土壤中的有益菌以削弱病菌；增施钾肥，增强棉株抗病能力；花铃盛期满足水肥供应，不使棉株超负荷结铃等。
纵观几个棉花黄枯萎病的易发病期，都是由“内虚外感”两方面的因素引发的。第一段：出苗后，子叶中贮存的养分已用完，棉苗的根系尚未建成，一旦遇到低温、地湿、土硬、除草剂危害、速效养分匮乏等，极易诱发病害；第二段：6月中下旬，棉花由营养生长转入营养生长和生殖生长并行，棉株即将开花，对养分的消耗突增，而发达的根系尚未建成，如遇多雨、低温、地湿、干旱、土壤板结、缺钾等不利条件，又极易诱发病害；第三段：8月中下旬，此时中下部已结铃，大雨后土壤速效养分被淋溶，棉株已极度虚弱，如养分供应一旦中断，或养分不平衡，又会诱发病害。所以当前控制黄萎病的着重点应是增强棉花体质。
实践证明：对发病轻的棉田和刚发病的棉田，或点片发病的棉田，采用“一控两促”化学防控的思路，具体方法：杀菌剂（控制发病）加营养剂（促生长）加促进型调节剂（促壮苗）。杀菌剂可选用多菌灵、乙蒜素、70%敌磺钠、3%多抗霉素、36%棉枯净、70%恶霉灵等；营养剂可选用磷酸二氢钾、黄腐酸钾或其它磷钾肥等；促进型调节剂可选用芸苔素内酯、复硝酚钠等。
缺钾地再加喷钾效果更好，可增强棉花体质，提高棉株抗病耐病能力，延缓病害的发展。黄萎病症状表现在叶片，受害最重的则是茎秆内部，喷洒杀菌剂和助长剂则很难奏效，只有采用联合疗法减缓黄萎病发病才能达到降低危害的作用。
喷施制剂主要着眼于保护未发病的叶片和棉株，控制刚发病的叶片和棉株，延缓其发病和扩大病情。至于对病入膏肓的棉株要求喷药后起死回生，或者病叶喷药后完好如初则是不可能的。现在立即采取措施还不晚，对轻病地和刚发病地只要措施到位，完全可以将黄萎病限制在可控范围内，不会对产量造成大的影响。