6月中下旬到7月中下旬，南方地区常遭暴雨袭击，局部地区易出现洪涝灾害。如出现洪涝灾害，除开展常规补救措施外，还要注意防细菌性病害流行和迁飞性害虫大暴发。
防细菌性褐条病流行。随着洪水泛滥，病菌得以扩散，并通过雨水和洪水期间稻株造成的伤口进行传播和侵染。受淹稻株抗性下降，更有利于病害流行。洪涝过后到病害流行有一个过程，因此，对洪涝区域内的中稻、一季晚稻要勤检查，不可麻痹大意。2003年6月中旬新邵县酿溪兔子坪等村连降暴雨，暴雨过后，该村迟熟中稻出现了细菌性褐条病的发病丘块，一些迟熟中稻心叶变黄卷曲，出现了“枯心苗”，有些农户把其当作钻心虫来防治，结果无济于事。与钻心虫不同的是，细菌性褐条病危害造成的枯心苗，无虫孔、无虫粪，也找不到虫子，基部枯黄腐烂，有恶臭味。整个植株受累，生长缓慢，发病重者全株死亡，这是分蘖期受害常表现的症状；秧苗期发病常表现为叶片基部或叶鞘上产生水渍状绿条斑，后变成浅黄色，并沿叶脉上下延伸，最后逐渐变成深褐色长条斑；抽穗期发病，剑叶及其下的1～2片叶和叶鞘出现褐条或心腐，病株较健株早抽穗3～5天，并明显高于健株，穗颈上为褐色条斑，严重时穗颈上下成段变褐，形成枯穗和小枝梗部分或全部变褐、弯曲，变成畸形穗，不实，有时出现半包穗或死胎现象。所有病株在湿度大时可产生黄白色菌脓，病重时田间有腥臭味。防治细菌性褐条病，要在排水露田的基础上，选用20%叶青双600～800倍液或5%菌毒清300～400倍液喷施，每5～7天1次，连续2～3次。
防暴雨后细菌性条斑病流行。暴雨常伴随着大风造成稻株大量伤口，有利于病菌侵入，高温促进病斑扩展，而高湿有利于病菌的传播。发病时，在叶片的叶脉间产生黄褐色条斑，可长达1厘米以上，对光呈半透明状，病斑上有许多蜡黄色菌脓。防治此病要防串灌，发病时用20%的叶青双600～800倍液和5%菌毒清300～400倍液交替用药，一般用药2次，隔5～7天1次，兼治白枯病。
防迁飞性害虫突增。第三代和第四代稻纵卷叶螟幼虫（常常世代重叠）为害孕穗期到抽穗期的中稻；第三代褐飞虱（稻飞虱的主要类型）为害8月份的水稻。这两种迁飞性害虫除来自本地虫源外，还有伴风雨、特别是随大雨期间倒槽气流由北降落到南方的虫源。因此暴雨期间常出现这些迁飞性害虫突增现象。大雨后要密切注意调查。当分蘖期卷叶率达7%～9%、孕穗期卷叶率5%～7%时用5%锐劲特600～800倍液喷雾防治；当稻飞虱若虫达到每百蔸1000～1500只时用10%蚜虱净（一遍净、大功臣、吡虫啉、康福多）2500～3000倍液防治。