龙眼树彩果完成后3～5天内，需及时修剪掉枯老枝条、细弱枝条、生长过于密集的枝条以及交叉重叠枝条。还需对回缩枝条进行回缩校组，保留基部20～25厘米的枝条，并对长势较为衰落的母枝和徒长枝进行短截。
在龙眼树生长旺盛期间，需采取打顶的方法进行修剪，可使用消毒后的锋利剪刀，修剪掉龙眼树上顶部长出的嫩芽，抑制顶部枝条的生长，促使龙眼树长出更多分枝用于结果。修剪完成后需往伤口处涂抹草木灰进行杀菌消毒处理。
在每年夏季还需对龙眼树进行疏枝修剪，修剪可选择在凉爽的傍晚进行，可修剪掉龙眼树上生长过于密集的枝叶，提高龙眼树枝叶间的通风性和透气性，从而提高龙眼树的产量与质量。
修剪完成后，需为龙眼树浇灌一次水分，可选择浇灌天然水、河水，使土壤处于微微湿润的转态即可。此外，还需每隔半个月施加一次磷钾复合肥来加快龙眼树的生长速度。