水稻纹枯病菌主要通过种子、土壤和噬食水稻的害虫传播。其中，种子传播是最为常见的途径。感染的种子携带病菌通过播种，使得新生苗期就受到了感染。病菌也可以通过土壤中的残留物或者宿主植物的残体传播，从而持续感染水稻田。此外，一些噬食水稻的害虫，如螟虫、蚜虫等，也可以通过咬食的方式将病菌传播给水稻植株。
病菌侵入水稻植株后，主要通过植株的气孔、伤口或者叶片表皮的裂隙进入植株内部。一旦进入，病菌就会在植株内进行繁殖和扩散。它会感染水稻的叶片、茎、穗和种子等部分，导致植株出现黄化、叶片倒卷、叶鞘发黑、茎秆腐烂等症状。严重的感染会导致水稻叶片凋落，穗部变黑，甚至导致整株植株死亡。
水稻纹枯病的防治主要依靠病害耐病品种的选育和病害管理措施。耐病品种的选育可以通过杂交育种、基因工程等手段进行，以提高水稻对纹枯病的抗性。病害管理措施包括合理的田间管理，如轮作、适时灭茬、清除病残体等，以减少病菌的传播和扩散。此外，合理使用化学农药和生物制剂也是控制水稻纹枯病的一种有效手段。