1、提高育苗技术水平
选择地势高、干燥、排水良好的地块种植。对排水不良的低洼地，在四周挖好排水沟，实行针、阔叶树种轮作。苗圃地做成高床，床面平整。适当早播，播后覆土，厚薄均匀。扦插繁殖的花卉，插条应晾至微干后再扦插，以利伤口愈合。播种不宜过密，及时间苗，保持通风良好。结合整地分层施足腐熟有机肥，以改善土质，抑制病菌，并做到看苗、看地、看天施肥，氮、磷、钾合理搭配，以增强苗木抗性。及时揭草、松土、除草、培土、间苗、排水等，为苗木生长创造一个较好的环境。
2、种子和土壤消毒
猝倒病的病原菌能长期在土壤内存活，因此直接消灭土壤内病原菌对控制发病极为重要。苗床土壤可用50%的多菌灵或50%的福美双，或40%的五氯硝基苯，或40%的拌种双，每平方米用药量6至8克。施用时先将药称好，然后用适量细砂土混合拌匀即成药土，部分药土于播种前撒于播种行内，剩下部分播后覆盖种子。播种前，要将种子用敌克松、福美双等拌种消毒。
3、及时施药防治
在发病前，苗木幼嫩期间，可用石灰粉与草木灰以l：4的比例混合均匀，每亩苗床撒施100-150公斤，防病效果良好。也可在出苗期开始，每隔7-10天，每亩苗圃用波尔多液喷洒幼苗，使幼苗外表形成保护膜，防止病菌侵入。幼苗发病期可用敌克松500-800倍液，或福美双400-500倍液，或退菌特1000至1500倍液，或70%的甲基托布津700倍液灭菌保苗。注意喷洒幼苗嫩茎和中心病株及周围的病土，每7-10天喷一次，连喷2-3次。