南方红豆杉属生长缓慢的树种，又是雌雄异株植物，种子结实量小，且种胚后熟休眠期长，存在种子发芽不整齐，发芽率不高等问题。而南方红豆杉近期原料林的发展，是以密集种植的苗期利用为策略，故采取大批量扦插的繁殖方式是实现这一策略的基础。对其扦插育苗技术作如下分述。
1、插穗南方红豆杉以幼龄硬枝带叶扦插的方式最佳。最好的插穗是选用充分木质化的1年生枝和2年生枝；3年生枝也可使用；而用4年生以上的枝条作插穗，其生根能力明显下降，已不宜采用。插穗以用萌生枝最好，顶部的侧枝次之。用作插穗的枝条以粗壮者为佳，过于细弱的枝条不宜采用，一般直径低于2mm的枝条就很难操作也不易成活。对插穗长度进行的专门试验结果表明截短至1cm长的插穗，也可生根，而且还出现了3株单叶叶柄生根的植株。南方红豆杉属易扦插生根的树种，长度1cm、3cm、5cm、10cm的插穗，无论生根率及其苗木生长量都随插穗长度的增加而增长。因此，生产中可根据插穗资源量及苗木需求等状况，灵活截取5～20cm长度的枝条做插穗。且较为短小的侧生顶枝都可利用。短穗条扦插试验的成功，为实际生产中提高穗用枝条的利用率提供了依据。剪好的穗条，要将入土段的叶子捋除。按级分成50条一捆，以便插前处理及搬运。扦插实行分级扦插、分级管理，是提高成苗率、降低生产成本的重要措施。
2、扦插基质以河砂、珍珠岩、土壤作基质用于南方红豆杉扦插均获得成功，其中以土壤作扦插基质最好。高山草甸土、高山针叶林下的棕壤表土、山地红壤、黄壤、黄色赤红壤、菜园土等都可做基质用土，其中以疏松、肥沃的高山草甸土、棕壤表土、菜园土最好。可因地制宜选用。在扦插床内铺设上厚度为15cm的基质即可，为此土床整地深度应是20cm。
3、插穗和插床处理（1）插穗处理为避免大批量扦插时用大容器长时间浸泡穗条，故采用较高浓度的植物生长激素作蘸条处理。于处理前先用75%的可湿性百菌清粉剂600～750倍液浸蘸穗条，甩干后，再蘸浓度为500mg？L-12号ABT生根粉或吲哚丁酸，甩干后即可进行扦插。也可换用多菌灵或25%可湿性粉剂400倍液来进行插穗的消毒。（2）插床处理于扦插前2～3天用少量生石灰（10g/m2）或高锰酸钾溶液（0.03%）拌入插床进行土壤消毒。
4、扦插季节密度及其要点（1）扦插季节南方红豆杉全年扦插都有成功实例，但在云南的大多数地区以春插最好。若在1～2月整地，春节后采条扦插，至4月初完成。7月以前插条可以生根，于1年后雨季初期出圃，是最佳的安排。（2）扦插密度扦插密度主要根据插穗的大小来选择。实施过的最大扦插密度的株行距为2cm×5cm，每666.7m2可插50万条。以4cm×5cm、4cm×6cm为适中的扦插株行距，采此株行距每666.7m2可插25万条和21万条。（3）扦插要点采取直插，入土深度以能稳固插穗为准，一般入土深度为穗条长度的1/3～1/2。扦插时制作与扦插行距（如5cm、6cm）同宽刻有尺度的模板，于扦插时使用，好按行扦插，以达整齐化的目的。扦插深度以手指掐住穗条深插入土后，不掐条的手指能触及土面来控制。插满一床后，及时浇透水。不但要让扦插层土壤湿透，还要让翻松的土壤与插穗紧密接触，这与定植苗木时要浇透定根水同理。
5、扦插圃设施扦插圃设施可以多样，基本的要求是要能对温度、湿度、光照作合理控制。经各地多年实践、改进，适用于山地大批量扦插育苗圃地的基本设施是:遮光棚（网）、温棚、灌溉网。（1）遮光棚（网）的作用是为苗床遮光和降温。遮光度要根据各地气候和育苗期间的温度状况而定，遮光度为50%～90%。插穗生根后，要逐步减少遮光，以利于苗期的生长。遮光棚（网），可用市售的薄膜遮光网，也可就地取材用竹木架、树枝叶搭建。（2）温棚的作用是增加苗床的温度和湿度。可在各种大的温室，温棚中扦插育苗。一般均用竹子搭建薄膜拱棚。以高棚（高2m）、低棚（高0.5m）两种使用最多。高棚两端设门，低棚全部封闭，苗床管理时需掀膜作业。也有在大温棚中再搭小温棚的双重棚，在西藏林芝甚至用三重温棚来达到保温的作用。在棚内外均要安放温度计与湿度计，以便准确掌握温湿度。温棚要密闭，以温棚薄膜上能否生成水雾（标明棚内空气湿度达饱和状态）为适宜。（3）灌溉网要能灌能排，不使扦插床积水和过干，最好是管道和喷雾灌溉，禁止流水漫灌和浸泡苗床。
6、插后管理（1）温湿度的控制温度以稳定为25～30℃最佳，温度低于10℃插穗可能不会生根，低于20℃或高30℃要采取措施增温或降温。增温的措施主要是减少插床的遮光，或者在夜间加盖草席；降温的措施主要是增加插床的遮光和喷水，开启温棚门或是掀开温棚薄膜。插床的土壤水分最好临近饱和，但不要淹水;空气最低的相对湿度应保持在80%以上。中午气温升高时相对湿度会明显下降，如下降到60%以下，应适当喷水（雾），这样既可加湿又可降温。密闭温棚可长时间保持温棚内的高湿环境，有利于南方红豆杉插条生根。温棚薄膜上有水雾凝结说明棚内湿度高，待无水雾时再浇水。（2）除草扦插苗圃选用的是肥沃土地，而肥沃的土地上杂草生长特别迅速、繁茂。因此，除草是圃地管理的重要措施，以除早除小除了为原则，防止杂草与苗木的恶性竞争。（3）追肥插床土壤肥沃就可不用追肥。但在生根过迟或在幼苗生根之后，向叶面喷施低浓度的磷酸二氢钾和尿素，具有促进苗木生长的作用。