柑橘病虫害主要有柑橘红蜘蛛、柑橘粉虱、潜叶蛾、溃疡病、树脂病、炭疽病等。
在预报的防治适期内，对达到防治指标的病虫害要选择性使用高效、低毒、低残留农药进行防治，禁施高毒高残留农药。
柑橘叶螨重点在2月和8月压低虫源基数，3～6月和9～11月为高峰期，每叶5头以上的橘园，应及时喷药防治。防治药剂可选用阿维菌素、矿物油、螺螨酯、浏阳霉素、噻螨酮、哒螨灵等。
柑橘潜叶蛾幼树和初挂果树在夏秋梢抽发时，成年树在秋梢期防治，在梢长1～1.5cm时施药，隔7～10天再喷一次。药剂可选用吡虫啉、啶虫脒等。
柑橘粉虱在新梢期，成虫高峰期和高峰期后10～15天，选用噻嗪酮加啶虫脒或吡虫啉防治。
介壳虫4月下旬至5月上旬，挑治中心虫株；当多数橘树有活幼蚧的叶片超过5%时，全园普治。药剂可选用噻嗪酮、毒死蜱。
锈壁虱6～7月，如10%的果面上可见螨或开始出现零星的锈皮果，应及时用药防治。药剂可选用代森锰锌、浏阳霉素。
溃疡病重点在嫩梢和幼果期防治。春梢在叶片转绿期、夏梢在梢长5～7cm、幼果在直径0.8～1cm时用药防治，隔10天喷第二次药。药剂可选用噻菌铜、波尔多液（清园和春梢期使用）、中生菌素等。
炭疽病、树脂病当病叶率达到5%或出现急性病斑时，应及时用药防治，防治药剂可选用甲基硫菌灵、苯醚甲环唑、代森锰锌、咪鲜胺等。