冬茬西葫芦育苗时外界气温已开始下降，所以一般在温室中育苗，可在要栽培的温室中直接做育苗床育苗。在寒冷地区还要考虑温室内覆盖小拱棚进行育苗。如果温室育苗有困难(如倒茬时间紧或温室未建成等)，可在改良阳畦或阳畦中育苗，育苗时要注意用薄膜和草苫等覆盖物保温防寒。育苗也要尽可能地采用纸袋或营养钵等护根育苗，以利于定植后的生长和抗逆能力。
播种育苗时虽外界气温下降，但温室内温度还较高。播种后要盖上地膜，保温、保湿，白天保持28～30℃，夜间保持在18～20℃，经过3～5天即可出齐苗。西葫芦胚轴极易过度伸长而徒长，所以，幼苗出土后应及时揭去地膜，防止形成高脚苗。温室或阳畦一定要注意及时揭开放风口，降低温室或阳畦中的温度，以防幼苗徒长。出苗后白天温度保持在20～25℃，夜间为8～12℃。当白天的温度超过25℃时开始放风，降至20℃时缩小放风口或关闭风口。当畦内气温降至15℃左右时要覆盖草苫，保持早晨揭苫时6～8℃。育苗期间还要严格控制浇水，水分多，极易徒长。当出现干旱现象时，要选晴天上午进行浇水，浇水后必须加强通风，降低空气温度、湿度。定植前5～7天降温炼苗，以提高幼苗的适应性和抗逆性。育苗时易产生蚜虫等危害，要注意及时防治。在定植温室前一定要彻底打药治蚜，防止将有害虫的幼苗带入温室危害。
经过35～40天的育苗，要选择幼苗节间短，茎粗0.4～0.5厘米，高12～15厘米，株型紧凑，根系完好，达到3～4叶1心，无病虫的壮苗进行定植。