首先，是复配的农药物理性状不改变，即混合后不能出现浮油、絮结、沉淀或变色，也不能出现发热、产生气泡等现象。如果同为粉剂，或同为颗粒剂、熏蒸剂、烟雾剂，一般都可混用；不同剂型之间，如可湿性粉剂、乳油、浓乳剂、胶悬剂、水溶剂等以水为介质的液剂则不宜任意混用。
其次，是复配的农药不发生化学变化，以免产生药害。许多药剂不能与碱性或酸性农药混用，比如，在波尔多液、石硫合剂等碱性条件下，氨基甲酸酯、拟除虫菊酯类杀虫剂、福美双、代森环等二硫代氨基甲酸类杀菌剂易发生水解或复杂的化学变化，从而破坏原有结构；在酸性条件下，2，4-D钠盐、2甲4氯钠盐、双甲脒等也会分解，从而降低药效。除了酸碱性外，很多农药品种不能与含金属离子的药物混用，比如二硫代氨基甲酸盐类杀菌剂、2，4-滴类除草剂与铜制剂混用可生成铜盐降低药效；甲基硫菌灵、硫菌灵可与铜离子络合而失去活性。除去铜制剂，其他含重金属离子的制剂如铁、锌、锰、镍等制剂，混用时要特别慎重。此外，石硫合剂与波尔多液混用可产生有害的硫化铜，也会增加可溶性铜离子含量；敌稗、丁草胺等不能与有机磷、氨基甲酸酯杀虫剂混用。
第三，生物农药不能与杀菌剂混用。
在保证正常发挥各自原有作用的前提下，尽可能考虑以下互补效果：复配杀虫、杀菌甚至除草剂，兼治同时发生的多种病虫草害，或混用不同杀菌谱的杀菌剂，扩大防治对象，达到减少施药次数的目的。这要求选择适当的时机和药剂。如在小麦抽穗灌浆期，混用三唑酮、吡虫啉和磷酸二氢钾既可兼治蚜虫、白粉病和锈病，又能促进小麦旗叶的生长，增加光合作用，延长小麦生长期，防止干热风的为害；将速效性药剂和药效高、但见效慢的药剂混用，如菊酯或毒死蜱与阿维菌素混用；将作用机制不同（无交互抗性）的药剂混用，既可以起到延缓抗药性上升的作用，也提高了防治效果和延长了药剂的有效期。
无论混用什么药剂，都应该遵循现用现配，不宜久放和先分别稀释，再混合的规定，最好先在小范围进行试验。