板蓝根生产上一般采用种子繁殖。选择籽粒饱满、发芽率为80%以上的优良种子播种。
板蓝根当年播种不开花，要培育到第2年才开花结果采集到种子。每年10月当地上茎叶枯萎时，挖起全根，选择生长健壮、无病虫害，粗大健壮、根直、不分叉的根条留作采种母株。在预先整好并施足基肥的育种地内。按行距50厘米、株距20~25厘米栽种。栽后及时浇水，以保成活。移栽的种根出苗后精心管理，多施磷钾肥，使其抽薹开花、籽粒饱满，培育到5~6月果实陆续成熟，便分期分批采集成熟种子。
在5~6月，待角果表面成紫褐色或黄褐色时陆续采收，晒干脱粒，放室内干燥荫凉处用麻袋贮藏。时间不宜太长，一般2年后发芽率下降。